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两个等位基因的本质区别在于它们控制合成的蛋白质的种类或数量不同。等位基因位于同源染色体的同一位置,通常负责控制同一性状的表现。具体来说,以下是其主要区别:

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1. **DNA序列差异**:等位基因的不同主要源于它们的DNA序列差异。这些差异可以很小,比如一个碱基的替换,也可以很大,如插入或缺失一段DNA序列。

2. **表达产物**:由于DNA序列的差异,两个等位基因所编码的蛋白质在氨基酸序列上可能会有所不同,导致蛋白质结构和功能的差异。这种差异可能影响到蛋白质的活性、稳定性、与其他分子的相互作用等。

3. **表型表现**:因为等位基因编码的蛋白质不同,它们可能会导致个体在某一性状上的表现不同。例如,一个等位基因可能使植物对某种病害具有抗性,而另一个则没有这种抗性。

总之,等位基因之间的主要区别在于它们携带的遗传信息不同,这影响了它们所编码蛋白质的功能和个体的表现型。

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